Tu peux mettre ce en place avec GoogleMap en décrivant ton parcours dans un fichier .kml. Je crois même que le fichier .kml peut-être créer à partir de WayPoints d'un GPS !

Bon courage

Le mieux pour faire ça, ce sont les logiciels de cartographie avec fond de carte IGN : cartoexploreur, georando... On peut intégrer la trace, en la récupérant depuis un gps, en la téléchargeant sur le net... ou la tracer soit même avec le logiciel. Inconvénient, ces logiciels sont assez onéreux (surtout cartoexploreur) si on a une grande surface à couvrir.

sinon il y a aussi des logiciels qui permettent d'utiliser des cartes papier scannées en les calibrant (désolé je n'ai pas de nom sous la main).

Googleearth, c'est bien par certains cotés (gratuité, couverture mondiale)... Mais pas adapté pour l'utilisation désirée, puisqu'il n'existe pas de cartographie détaillée digne de ce nom.

Ce que tu compte faire demande une charge de travail énorme (cartographie au niveau national).
Perso,  plutôt que d'utiliser les  cartes au 1/25000, je fais mes cartes moi même en utilisant cette méthode, si ça peut t'aider:

1.Les cartes: suis cette méthode:
randonner-leger.org/wiki/doku.php?id=faire_sa_carte

Si tu n'as pas de Logiciel de retouche photo, tu peux utiliser Photofiltre, qui est gratuit et que tu trouveras ici:
01net.com/telecharger/windows/Multimedia/photo_numerique/fiches/21756.html

2. Les itinéraires: Quand tes cartes sont au format JPEG, tu peux les utiliser avec un Logiciel qui s'appelle Curvimètre qui est lui aussi gratuit et qui te permettra de tracer tes itinéraires. C'est ici:
xander.free.fr/info/curvimetre/

J'espère avoir été suffisament clair et avoir pu t'aider.

Pat

PS: Je n'ai pas pu te mettre directement les liens, désolé.